Jirô é um jovem com a habilidade de falar com animais, criado por seu avô e treinado como ninja. Rejeitado por ser diferente, encontra nos animais seus únicos amigos e os protege. Um dia, resgata Ragô, um gato preto ferido, mas descobre que ele é um mononoke, um espírito perseguido por uma organização misteriosa. Sem hesitar, Jirô decide ajudá-lo.