Braterstwo Róży opowiada historię Saula i Chrisa, dwóch sierot z Filadelfii. Zostają adoptowani przez mężczyznę o imieniu Eliot, który traktuje chłopców jak własne dzieci i wychowuje ich na zabójców. Kiedy misja Saula kończy się niepowodzeniem, a Chris zostaje wplątany w międzynarodowy incydent, zaczynają kwestionować swoje życie i misje, a także zaczynają postrzegać Eliota w nowym świetle.