Jirô è un ragazzo con la capacità di parlare con gli animali, cresciuto dal nonno e addestrato come ninja. Emarginato per la sua diversità, trova conforto negli animali e li protegge. Un giorno salva Ragô, un gatto nero ferito, ma scopre che è in realtà un mononoke, uno spirito braccato da un'organizzazione misteriosa. Senza esitazione, Jirô decide di aiutarlo.