Il y a longtemps, une secte d'épéistes connue sous le nom d'Épée de Logos protégeait le Livre des Anciens, un puissant tome d'histoire qui contient tout ce que l'homme connaît : mythes, créatures, histoires, science, technologie et évolution de la civilisation humaine. Cependant, il y a des milliers d'années, un traître travaillant pour le compte de Megiddo a tenté de le voler pour lui-même. En conséquence, le Livre a disparu et chacune de ses pages a été dispersée à travers le monde. Aujourd'hui, le jeune romancier Touma Kamiyama rêve d'une autre dimension où il voit des épéistes et des monstres sortir d'un livre d'histoires et une mystérieuse jeune fille l'appeler à l'aide. Un jour, un phénomène étrange se produit sans qu'on s'en aperçoive : une partie de la ville a disparu.